研究概况:Chong zchen, Ph ..D.
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郑泽晨博士.D.他在中国获得博士学位之前学习的是计算机科学. 他的许多计算机科学同事都从事信息技术(IT)方面的工作。. 但Chong设想了一条不同的道路. 他喜欢研究,并发现基因组学和基因组测序令人着迷.
有了他的训练,他认为他可以克服研究中的障碍.
“我注意到这是因为技术的限制, 基因组学中许多未解决的问题实际上是计算问题,他说. “So, 我决定利用我的计算技能,并将其应用于基因组学领域来解决这些问题,以改善人类的整体健康.”
今天, 遗传学助理教授, 他是阿拉巴马大学伯明翰医学院信息学研究所的研究员, Chong专注于揭示结构变化的许多作用. 结构变异——一种重要的基因突变——是基因和基因组结构的改变状态. 健康的人携带着结构上的变异, 但这些突变也有助于引发疾病, 比如一些癌症和一些遗传性孟德尔疾病. 结构变异还与包括心脏相关疾病在内的一些复杂疾病有关.
“因此,这个话题对人类健康非常重要. 这些突变是精准医疗的潜在目标——你可以设计特定的药物来针对结构变异等突变,Chong说.
然而,这一领域的研究还处于早期阶段. Chong and researchers like him are tasked with identifying and classifying structural variations in humans; then, 利用公开可用的工具和他们开发的工具来研究结构变异的功能和机制.
据Chong说,大多数现有技术使这项工作变得艰巨或不可能. 他说,要理解笔记本电脑或台式电脑上的大量数据是不可能的. 甚至大学计算机系也可能拥有更强大的计算平台, 但是,由于所有的研究人员都试图使用大学平台,因此计算资源有限,并且需要很长沙巴足球体育平台才能理解原始数据.
美国心脏协会精密心血管医学研究所提供了一种先进的技术——云计算环境,Chong需要这种技术来有效地推进他的研究, 他说.
“我们有很多数据——超过3000个样本. 研究所先进的云平台为我们提供了一个非常有效和快速处理这些数据的场所,他说.
Chong获得了研究院为期两年的资助,不仅可以使用研究院的云平台,还可以资助一名博士后进行云计算培训.
“这项资助使我们的研究员能够获得更高水平的数据科学和云计算技能. 该研究所创造了教育和培训下一代云计算和生物信息学研究人员的机会,Chong说. “这笔资金也确实推动了我们的研究,加快了我们的研究能力.”
先进的技术有助于将Chong的研究目标清晰地呈现出来.
“我们的长期目标是对所有类型的结构变异进行全面分类,并开发算法来研究这些结构变异的功能和机制,以及它们如何促成或提供疾病的一些线索,他说.